南昌航空大學創建于1952年，1985年開始培養碩士研究生，1990年獲碩士學位授予權，2010年，獲得推薦優秀應屆本科畢業生免試攻讀碩士研究生資格。同時，還與南京航空航天大學、北京航空材料研究院等多所高校及科研院所聯合培養博士生。
我?，F有博士生導師21人，碩士生導師578人；有雙職雙聘中國科學院院士和中國工程院院士4人；國家杰出青年科學基金獲得者2人，國家優秀青年科學基金獲得者2人，國家百千萬人才工程人選1人；全國優秀教師5人，全國模范教師2人；教育部“新世紀優秀人才支持計劃”2人；享受國務院政府特殊津貼26人；“井岡學者”2人；省學科帶頭人48人，省中青年骨干教師74人，省教學名師17人；中國工藝美術大師1人；省主要學科學術與技術帶頭人4人，省高校哲學社會科學領軍人才1人。高水平的導師隊伍為研究生的科研能力培養提供了有力的支撐。
現有13個一級學科碩士點，覆蓋了67個二級學科碩士點，并具有14個工程碩士領域和3個（公共管理碩士、藝術碩士、翻譯碩士）專業學位授予權。擁有五個國防特色學科：精確成形與連接技術、構件質量檢測與控制、測試計量技術及儀器、光電子與激光技術、軍用關鍵材料。
積極開展校企校所合作是學校研究生培養的鮮明特色之一。學校與洪都航空工業集團公司、昌河飛機工業（集團）公司、中國直升機設計研究所、中國航發南方工業有限公司等多家航空企事業單位聯合培養研究生。研究生依托這些單位科研任務和先進設備，將課題研究、論文撰寫與工程實踐領域的問題相結合，極大地提高了研究生的科研創新能力。通過產學研合作，學校成功地走出了一條將創新性人才培養引入到科研與生產前沿的新路。
學校還積極開展多種形式的國際合作與交流，先后與多個國家和地區的多所國外高校建立了長期校際合作關系，并常年聘請外籍教師來校任教。學校定期選派研究生赴相應國家留學，同時接收相應國家的留學生來校學習。
“十三五”期間，南昌航空大學研究生教育將以《國家中長期教育改革和發展規劃綱要（2010-2020年）》、《國家中長期科學和技術發展規劃綱要（2006-2020年》、《國家統籌推進世界一流大學和一流學科建設總體方案》等綱要為指引，圍繞國家戰略需求和區域經濟發展中的重大問題，堅持突出優勢、強化特色、優化結構、分層建設、重點突破、強化績效的原則，以面向需求、主動服務、交叉聚集、抓大促新、協調發展、提高質量為工作方針，加強頂層設計和布局，統籌博士學位授予單位申報和建設、省高水平大學和一流學科申報和建設，在擴大導師隊伍和招生規模的同時，加強過程管理，增強競爭機制。深化研究生教育改革，提高研究生培養質量，為江西經濟社會發展和國防科技工業提供人才與智力支撐。